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不同微生物菌及代謝產(chǎn)物是影響生物有機(jī)肥肥效的重要因素，通過直接和簡介作用影響有機(jī)肥肥效。生物有及有機(jī)肥中有機(jī)物質(zhì)種類和C/N值也是影響其肥效的重要因素，如粗脂肪、粗蛋白含量高則土壤有益微生物增加，病原菌減少，含C量高則有助于土壤真菌增多，含N量高則有助于土壤細(xì)菌增多，C/N值協(xié)調(diào)則放線菌增多，有機(jī)物中含硫的氨基酸含量高則明顯抑制病原菌，幾丁質(zhì)類動(dòng)物廢渣含量高將增加土壤木霉、青霉等有益微生物，簡介提高生物有機(jī)肥肥效。不同生物有機(jī)肥組成不同，其養(yǎng)分含量和有效性亦不同，含動(dòng)物性廢渣、禽糞、餅泊高的生物有機(jī)肥肥效高于含畜糞、秸稈高的生物有機(jī)肥。

      增加有機(jī)肥與生物有機(jī)肥使用量，合理減少化肥用量，加快農(nóng)業(yè)有機(jī)廢棄物無害化、資源化利用已成為21世界農(nóng)業(yè)生產(chǎn)的主流和風(fēng)向。今后應(yīng)進(jìn)一步加強(qiáng)選育高效微生物菌種高的研究，科學(xué)配方有機(jī)肥原料，不斷完善處理工藝、生產(chǎn)工藝及施肥技術(shù)，提高生物有機(jī)肥肥效，以促進(jìn)無公害農(nóng)產(chǎn)品和有機(jī)農(nóng)業(yè)的發(fā)展。